Después de ser derrotada nuevamente por un Ángel, la proporción de sincronización de Asuka sigue disminuyendo, afectando su habilidad para pilotar la Unidad 02. Los flashbacks revelan la trágica infancia de Asuka, que configuró su actual personalidad abrasiva. Un nuevo Ángel, Arael, aparece en la órbita de la Tierra, bien fuera del alcance de cualquier armamento terrestre, incluyendo los Evangelions. A Asuka se le dice que será el respaldo de Rei para la confrontación con el Ángel. Enfurecida, se lanza y se enfrenta a Arael por su cuenta, sin embargo Arael utiliza un ataque telepático que obliga a Asuka a revivir los acontecimientos traumáticos de su pasado, causando tal angustia mental que Asuka pierde por completo la sincronización y la Unidad 02 se cierra. Gendo ordena a Rei que vaya al Dogma Terminal, recupere la Lanza de Longino y la use contra el Ángel. El Lance logra penetrar el A.T. de Arael. Campo y lo destruye, pero la Lanza alcanza velocidad de escape y entra en una órbita lunar. Asuka vuelve a enfadarse por su derrota, empeorada por su odio hacia Rei.