La primera mitad de este episodio es un clip show, en forma de un informe de SEELE revisar las acciones de Gendo, resumiendo la primera temporada de episodios y la historia hasta este punto. En la segunda mitad, Ritsuko lleva a cabo un experimento para determinar si los pilotos pueden ser cambiados entre los Evangelions que normalmente pilotan. Rei puede sincronizarse bastante bien con la Unidad-01, pero cuando Shinji intenta sincronizarse con la Unidad-00, se vuelve violentamente loco dentro de la base, de una manera idéntica a la prueba fallida de activación que tuvo lugar antes de la llegada de Shinji a Tokio-3. Como antes, Unit-00 ataca la cabina de observación del hangar, rompiendo la ventana. Sin embargo, Rei estaba de pie en la ventana en vez de Gendo, como fue el caso en la primera prueba, haciendo que Misato Katsuragi se pregunte si Unit-00 estaba tratando de matar a Rei. Mientras tanto, Ritsuko siente que Unit-00 estaba tratando de atacar a Ritsuko misma. Al final del episodio, Rei usa Unit-00 para traer la Lanza de Longinus recuperada de la Antártida al nivel más profundo de la base de NERV, Terminal Dogma.